金属穿线管生锈后，可以通过以下几种方式进行处理：

表面清洁：使用干净的布或刷子将金属穿线管表面的灰尘和污垢清洗掉，以便进行下一步的处理。

去锈处理：使用去锈剂或砂纸等工具对金属穿线管进行去锈处理，将生锈的部位清理干净，以恢复金属表面的光亮度。

防锈处理：在金属穿线管表面喷涂防锈剂，以防止再次生锈。防锈剂的种类繁多，可以根据实际情况选择合适的防锈剂。

更换：如果金属穿线管的生锈程度较严重，或者使用寿命已经到了，可以考虑更换新的金属穿线管，以确保使用效果和安全性。

需要注意的是，金属穿线管的防锈处理应定期进行，以延长使用寿命和避免安全隐患。